Omega‑6-Fettsäuren sind ebenfalls essentielle mehrfach ungesättigte Fettsäuren, z. B. Linolsäure (LA), die für Hunde und Katzen lebensnotwendig sind. Sie fungieren als Vorläufer für Arachidonsäure, welche an Entzündungs- und Immunreaktionen beteiligt ist. In normalportioniertem Futtermittel treten Omega‑6 meist in ausreichender Menge auf, da sie z. B. in Pflanzenölen wie Sonnenblumen- oder Maisöl enthalten sind.
Ein zu hoher Omega‑6-Anteil im Vergleich zu Omega‑3 verschiebt das Entzündungs-Gleichgewicht in Richtung Pro-Entzündlichkeit. Für eine gesundheitsfördernde Wirkung wird empfohlen, das Verhältnis stabil bei etwa 5–10:1 (Omega‑6:Omega‑3) zu halten. Bei Hautproblemen oder Allergien ist oft eine Reduktion von Omega‑6 und gezieltes Ergänzen von EPA/DHA ratsam.
